当长时间不使用电主轴时，需要做好保护，避免发生损坏。需要在主轴上装一刀柄，以保护卡刀的锥孔，主轴在没有装上刀柄的情况下是不允许转动的。
只有锥形的刀柄和具有良好动平衡特性的刀具才可以在高速转动下使用。不要使用被打孔的刀柄。
在安装时因为电主轴的轴承需要保持清洁，所以主轴的连接操作应在干净的环境中进行，否则轴承的寿命将显著减少。
电主轴的润滑
油雾润滑钢球轴承更换成陶瓷球混合轴承；电机绝缘等级提高；增加气密封装置；改造机械密封方式；检测和调整弹簧预紧力；隔圈调整等。油雾不进入电主轴内部，减少转子摩擦阻力，降低对定子线圈的腐蚀，增加电主轴的使用寿命。
电主轴轴承沟道润滑充分保障，润滑膜厚，振动降低，对轴承的保护加强，延长轴承的使用寿命进而延长电主轴的使用寿命。
电主轴使用完毕后需按照步骤来进行关机，但有时候电主轴出现的一些情况使得我们不得不强制性关机
1.电主轴轴承的温度急剧上升，已经达到了报警值，需要强制关机。
2.电主轴轴承或者密封的地方冒烟，这时候需要强制关机。
3.电主轴轴承出现不正常的运转时，需要强制关机。
4.电主轴内部出现不正常摩擦的声音或者噪音过大时需要强制关机。