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反硝化反应为 6NO3-+ 5CH3OH → 3N2+ 5CO2 + 7H2O + 6OH- ，根据此反应去除1mg NO3-N 需要1.9mg CH3OH。以CH3-OH作为碳源比以葡萄糖作为碳源反硝化速率快很多。CH₃OH/CH₄O在保存和使用上都需要多注意，对人体有低毒，因为在人体新陈代谢中会氧化成比毒性更强。葡萄糖：若一葡萄糖作为碳源9C6H12O6)，C6H12O6：NO3 -N 大约为7左右，容易引起细菌的大量繁殖，导致污泥膨胀，增加出水中COD的值，影响出水水质。建议用葡萄糖，用葡萄糖效果还是不错的，面粉效果比葡萄糖差。
面粉：这里说的面粉为小麦精致面粉，成分上也是非常高的。当缺氧或者厌氧池子中的污泥浓度较低时，通过以小麦面粉补充碳源对活性污泥的形成是有着很大的帮助的。同时，面粉也较容易买到。如设备的容积比较小，可以考虑以面粉作为碳源。
乙酸钠：若以乙酸钠（CH3COONa)作为碳源，是小分子有机酸的原因， 反硝化菌易于利用，脱氮效果是较好的。一般冬天时投加碳源，都是建议可以选择乙酸钠作为碳源投加，易溶于水，易被微生物所利用，所产生的污泥量相比于其他碳源时略高，花费上也是高于以面粉，葡萄糖，CH₃OH/CH₄O作为碳源的。
复合碳源是针对反硝化细菌配套开发的，除含有挥发性脂肪酸，生物素外，还含有微生物生长因子和群体感应信号分子，反硝化细菌专一利用，脱氮效果高且稳定。在废水处理中群体感应信号分子能够调控细菌的多种生理生化功能(如脱氮基因表达、群游现象和生物膜的形成等),从而提高废水处理效率。该碳源基本适用于市场现有的反硝化脱氮异养菌株。同时其它非功能性微生物利用效果差，避免了碳源投加量大，污泥膨胀的风险。鉴于碳源是为了补充生物的营养，提高生物的活性，从而达到去除总氮的目的。
复合碳源是针对反硝化细菌研发，更易被生化污泥中的反硝化细菌利用，不易被丝状菌等引起污泥过度增长的微生物利用。对比葡萄糖污泥产量更低，可以降低污泥处理费用。 投加方便，降低人工成本 葡萄糖固体度低，投加程序复杂，相应增加人工成本，液体葡萄糖冬季易结晶影响脱氮效果，复合碳源液体，投加方便，使用过程中不需要人工配置，同时可以更好控制投加量，避免碳源浪费，复合碳源具有冰点低等特点无色度、不发酵、不胀气、不酸化、不水解 液体葡萄糖易发酵胀气，储存不当可能会造成罐体崩开，复合碳源不会出现发酵胀气情况，同时不会酸化、水解，不会对出水色度造成影响。